) Indique os peptídeos que resultariam da clivagem pelo reagente indicado:
His-Lys-Leu-Val-Glu-Pro-Arg-Ala-Gly-Ala by trypsin
His-Lys-Leu-Val-Glu-Pro-Arg-Ala-Gly-Ala by trypsin
Passo 1
O enunciado pede: a partir do peptídeo “His-Lys-Leu-Val-Glu-Pro-Arg-Ala-Gly-Ala”, indicar os fragmentos (peptídeos) que resultarão da clivagem pelo reagente indicado: tripsina (trypsin).
Informações dadas pelo enunciado: o peptídeo completo é His‑Lys‑Leu‑Val‑Glu‑Pro‑Arg‑Ala‑Gly‑Ala (10 resíduos, na ordem dada) e a enzima reagente é trypsin.
Informações dadas pelo enunciado: o peptídeo completo é His‑Lys‑Leu‑Val‑Glu‑Pro‑Arg‑Ala‑Gly‑Ala (10 resíduos, na ordem dada) e a enzima reagente é trypsin.
Passo 2
O que a tripsina faz — aula rápida e prática:
- A tripsina é uma protease que corta ligações peptídicas no lado carboxila (à direita) de resíduos de lisina (Lys, K) e arginina (Arg, R). Ou seja, ela quebra imediatamente depois de um Lys ou de um Arg.
- Regra importante: a tripsina NÃO corta se o resíduo seguinte for prolina (Pro, P). Em termos simples: se houver Lys/Arg seguido por Pro, aquele sítio fica protegido e não é clivado.
Exemplo curto: em “Ala-Lys-Leu” a tripsina corta entre Lys e Leu; em “Ala-Lys-Pro” a tripsina NÃO corta entre Lys e Pro.
Passo 3
Vamos numerar os resíduos para ficar visualmente claro (número entre parênteses é a posição):
His (1) - Lys (2) - Leu (3) - Val (4) - Glu (5) - Pro (6) - Arg (7) - Ala (8) - Gly (9) - Ala (10).
His (1) - Lys (2) - Leu (3) - Val (4) - Glu (5) - Pro (6) - Arg (7) - Ala (8) - Gly (9) - Ala (10).
Passo 4
Aplicando a regra da tripsina ao nosso peptídeo:
- Procure Lys e Arg: há um Lys na posição
e um Arg na posição . - Verifique se cada um é seguido por Pro:
- Lys em
é seguido por Leu (posição ), que NÃO é Pro → sítio clivável. Corte entre e . - Arg em
é seguido por Ala (posição ), que NÃO é Pro → sítio clivável. Corte entre e .
- Lys em
Não há outros Lys/Arg no restante da cadeia, então apenas esses dois cortes ocorrem.
Passo 5
Fazendo as quebras nas posições identificadas (entre
–
e entre
–
), separamos o peptídeo em três fragmentos correspondentes aos intervalos de resíduos:
–
,
–
e
–
. Agora escrevemos as sequências desses fragmentos:
- Resíduos
– : His‑Lys - Resíduos
– : Leu‑Val‑Glu‑Pro‑Arg - Resíduos
– : Ala‑Gly‑Ala
Resposta
His-Lys
Leu-Val-Glu-Pro-Arg
Ala-Gly-Ala
Leu-Val-Glu-Pro-Arg
Ala-Gly-Ala