34^{\circ} ) Indique os peptídeos que resultariam da clivagem pelo reagente indicado:
Ser-Phe-Lys-Met-Pro-Ser-Ala-Asp by cyanogen bromide

Passo 1

Enunciado e dados: a cadeia peptídica fornecida é \text{Ser-Phe-Lys-Met-Pro-Ser-Ala-Asp} e o reagente indicado é brometo de cianogénio (cyanogen bromide, CNBr). O que o problema pede: indicar os peptídeos que resultarão da clivagem por esse reagente (ou seja, listar os fragmentos peptídicos formados após a reação).

Passo 2

Entendendo o comportamento do reagente (aula curta, mas importante). O brometo de cianogénio (CNBr) tem especificidade bem conhecida: ele cliva a ligação peptídica no lado carboxila (C-terminal) do resíduo de metionina ( \text{Met}). Em linguagem simples: CNBr “corta” logo após cada \text{Met} da cadeia, separando a cadeia em dois fragmentos no ponto depois da \text{Met}. Além disso, quimicamente o resíduo de \text{Met} que fica no fragmento N-terminal é convertido (sob as condições usuais ácidas) em uma unidade chamada homoserina-lactona (abreviada muitas vezes por \text{Hsl}). Em algumas condições pode ficar como homoserina ( \text{Hse}), mas o produto clássico citado em livros é a homoserina-lactona.

Passo 3

Conte os resíduos e localize a(s) \text{Met}. Numerando a sequência dada:
\begin{aligned} 1 &:\\ \text{Ser} \\\\ 2 &:\\ \text{Phe} \\\\ 3 &:\\ \text{Lys} \\\\ 4 &:\\ \text{Met} \\\\ 5 &:\\ \text{Pro} \\\\ 6 &:\\ \text{Ser} \\\\ 7 &:\\ \text{Ala} \\\\ 8 &:\\ \text{Asp} \end{aligned}
Aqui há uma única \text{Met}, na posição 4. A clivagem por CNBr ocorrerá entre os resíduos 4 ( \text{Met}) e 5 ( \text{Pro}.

Passo 4

Escrevendo os dois fragmentos lineares imediatos (antes de mencionar a modificação química da \text{Met}):
  • Fragmento N-terminal (resíduos 1 a 4): \text{Ser-Phe-Lys-Met}.
  • Fragmento C-terminal (resíduos 5 a 8): \text{Pro-Ser-Ala-Asp}.

Passo 5

Aplicando a modificação química típica do CNBr: a \text{Met} no final do fragmento N-terminal é convertida em homoserina-lactona ( \text{Hsl}). Portanto o fragmento N-terminal final será \text{Ser-Phe-Lys-Hsl} (onde \text{Hsl} = homoserina-lactona). O fragmento C-terminal permanece \text{Pro-Ser-Ala-Asp} sem alteração do seu início (pois o corte foi no lado C-terminal da \text{Met}).

Passo 6

Resumo didático rápido para a prova: ao ver “clivagem por CNBr” procure imediatamente por metioninas e “corte após Met”, e lembre-se de anotar que a Met do fragmento N-terminal vira \text{Hsl}. Isso resolve rapidamente questões desse tipo sem cálculo, só leitura da sequência e localização das \text{Met}.

Resposta

\text{Ser-Phe-Lys-Hsl}
\text{Pro-Ser-Ala-Asp}

Exercícios relacionados