34^{\circ} ) Indique os peptídeos que resultariam da clivagem pelo reagente indicado:
Val-Arg-Gly-Met-Arg-Ala-Ser by carboxypeptidase A

Passo 1

O enunciado dá o peptídeo Val- Arg- Gly- Met- Arg- Ala- Ser e pede que eu indique os peptídeos (produtos) que resultariam da clivagem por carboxipeptidase A.\n
Informações dadas:
  • Peptídeo inicial: Val- Arg- Gly- Met- Arg- Ala- Ser.
  • Reagente: carboxipeptidase A.
  • Pergunta: quais são os produtos (peptídeos/aminoácidos) após a ação desse reagente?

Passo 2

O que faz a carboxipeptidase A (explicação didática e passo a passo do conceito):
  • A carboxipeptidase A é uma exopeptidase que age a partir da extremidade carboxila (C-terminal) do peptídeo, hidrolisando a ligação peptídica mais externa e removendo resíduos um a um do C‑terminal.
  • Importante: a especificidade dela é tal que ela consegue remover resíduos com cadeias alifáticas ou aromáticas (por exemplo Phe, Leu, Ile, Val, Met, etc.), mas ela NÃO consegue remover resíduos carregados basicamente como Arg e Lys nem Pro. Ou seja, ela vai retirando resíduos do C‑terminal sucessivamente até encontrar um resíduo que ela não pode clivar (ex.: Arg ou Lys), e então para.
  • Em prova: pense sempre “começa pelo final (C‑terminal) e vai tirando um por um; para quando encontra Arg/Lys/Pro (ou outros que não são substrato)”.

Passo 3

Aplicando ao peptídeo dado — primeiro corte:
  • Peptídeo inicial: Val- Arg- Gly- Met- Arg- Ala- Ser.
  • A carboxipeptidase A vai primeiro remover o resíduo C‑terminal Ser (pois Ser não é básico e pode ser clivado por CPA).
  • Produtos após o primeiro passo: peptídeo Val- Arg- Gly- Met- Arg- Ala + aminoácido livre Ser.

Passo 4

Segundo corte (continuação sequencial):
  • Agora o novo C‑terminal é Ala no peptídeo Val- Arg- Gly- Met- Arg- Ala.
  • A carboxipeptidase A pode remover Ala (é um resíduo não básico), então ela hidrolisa essa ligação e libera Ala.
  • Produtos após o segundo passo: peptídeo Val- Arg- Gly- Met- Arg + aminoácidos livres Ala e Ser.

Passo 5

Por que a reação para aqui?
  • O novo C‑terminal do peptídeo remanescente é Arg (peptídeo Val- Arg- Gly- Met- Arg).
  • A carboxipeptidase A não cliva resíduos Arg (resíduos básicos). Portanto ela não consegue remover esse Arg terminal e a clivagem sequencial termina.
  • Para remover esse Arg seria necessário outro tipo de enzima (por exemplo carboxipeptidase B prefere resíduos básicos).

Resposta

Val- Arg- Gly- Met- Arg
Ala
Ser

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