34^{\circ} ) Indique os peptídeos que resultariam da clivagem pelo reagente indicado:
Leu-Gly-Ser-Met-Phe-Pro-Tyr-Gly-Val by chymotrypsin

Passo 1

O enunciado dá a sequência peptídica e pede que eu indique os peptídeos resultantes após clivagem por quimotripsina. Sequência fornecida:
Leu-Gly-Ser-Met-Phe-Pro-Tyr-Gly-Val
Pergunta: quais fragmentos (peptídeos) aparecem quando essa cadeia é tratada com quimotripsina?
Informações relevantes do enunciado:
  • Sequência completa: Leu — Gly — Ser — Met — Phe — Pro — Tyr — Gly — Val
  • Reagente: quimotripsina (enzima protéica específica)

Passo 2

O que faz a quimotripsina? (aula curta e prática)
  • Quimotripsina é uma serina-protease que rompe ligações peptídicas.
  • Especificidade principal: corta preferencialmente no lado carboxílico (lado C-terminal) de resíduos aromáticos grandes: principalmente Phe (fenilalanina), Tyr (tirosina) e Trp (triptofano). Em alguns casos também aceita resíduos hidrofóbicos grandes (ex.: Leu, Met), mas o alvo clássico são os aromáticos.
  • “Lado carboxílico” significa que a clivagem ocorre depois do resíduo especificado; por exemplo, se houver …-Phe-Ser-…, a quimotripsina tende a quebrar o vínculo entre Phe e Ser, ficando Phe na extremidade C-terminal de um dos fragmentos.
  • Notas práticas para prova: identifique os aminoácidos alvo (Phe, Tyr, Trp) e corte a cadeia imediatamente após esses resíduos.

Passo 3

Aplicando a especificidade à sequência: vou numerar os resíduos para ficar claro.
1: Leu
2: Gly
3: Ser
4: Met
5: Phe
6: Pro
7: Tyr
8: Gly
9: Val
Residues aromáticos na sequência: Phe em posição 5 e Tyr em posição 7. Portanto pontos prováveis de clivagem: entre os resíduos 5–6 (após Phe) e entre 7–8 (após Tyr). Escrevendo a cadeia e marcando as quebras esperadas:
Leu-Gly-Ser-Met-Phe | Pro-Tyr | Gly-Val

Passo 4

Verificação e atenção a detalhes (dica de prova): existe uma observação prática que aparece em alguns livros — a presença de Proline imediatamente após o resíduo alvo (ou seja, Pro em posição P1’ ) pode dificultar ou inibir a clivagem por certas proteases. Aqui, após Phe vem Pro (Phe–Pro). Portanto, em condições reais há possibilidade de que a clivagem Phe|Pro seja menos eficiente. Mas, salvo indicação contrária no enunciado, o comportamento padrão pedido em exercícios acadêmicos é cortar após Phe e após Tyr. Vou seguir esse critério padrão (corte após Phe e após Tyr) porque é o que normalmente se pede em questões do tipo.

Passo 5

Formação dos fragmentos efetivos: cortando após Phe (posição 5) e após Tyr (posição 7) obtemos três fragmentos:
  • Fragmento A: resíduos 1 a 5 → Leu-Gly-Ser-Met-Phe
  • Fragmento B: resíduos 6 a 7 → Pro-Tyr
  • Fragmento C: resíduos 8 a 9 → Gly-Val
Explico como montar cada um: pegue a sequência original e faça as quebras nos locais indicados; os grupos de aminoácidos entre as quebras são os peptídeos produtos.

Resposta

Leu-Gly-Ser-Met-Phe
Pro-Tyr
Gly-Val

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